その店舗兼居宅の所有名義が両親のどちらかの名義でありその者が土地を賃借しているものとしてお答えします。
地主が土地を明け渡してほしいとと云うことは「その建物を売って下さい」と云うことと同じなわけです。そして１０００万円もらえるなら明け渡してもいいと云うなら「１０００万円で買った下さい。」と云うことになります。そこで、その１０００万円で妥当な金額かどうかを考えます。建物の価格と云うのは建物自体の価格と借地権価格と合算した価格です。４０年も経過している建物ですから建物の価格はほぼゼロと思えます。そうしますと借地権価格になりますが、これは土地の時価相場の２分の１から４分の３程度となっています。その違いは地域や場所によって違います。例えば、２０坪借りており、その付近の相場が坪当たり１００万円として借地権割合が７０％とすれば、２０×１００×０．７で１４００万円となります。その付近の借地権割合がどのくらいかは付近の不動産屋でもわかりますが正確に知りたいなら不動産鑑定士に聞くのが最も正解です。