＞ （１）立ち退く場合倉庫取り壊し費用は請求出来ますか？
所有権は相手にありますから取り壊し費用は相手の負担です。ただし、取り壊して引渡する約束なら負担しなければなりません。
＞ （２）立ち退き料は請求出来ますか？
できませんが、実際問題として明け渡さないなら裁判しなくてはなりませんから交渉もいいかもしれません。
＞ （３）また逆に「建物収去土地明渡」を求められる場合もあると思いますが、その場合、壊し費用は所有者が負担することになるでしょうか？
そうです。自分のものですから自分で処理しなければなりません。